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浙江大学团队系统性地解析了昆虫纲水平转移基因的分布、命运以及功能
2023年02月06日
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论文分享|诺唯赞


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Cell X Vazyme

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基本信息

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论文题目:HGT is widespread in insects and contributes to male courtship in lepidopterans

期刊:Cell

影响因子:66.85

作者及单位:浙江大学农业与生物技术学院研究生李杨、刘志国、刘超为共同第一作者,浙江大学农业与生物技术学院百人计划研究员沈星星、百人计划研究员黄健华、范德堡大学Antonis Rokas教授为共同通讯作者。

Vazyme合作产品:

T7 High Yield RNA Transcription kit(Vazyme #TR101,T7高产RNA转录试剂盒)

FastPure® Cell/Tissue DNA Isolation Mini Kit(Vazyme #DC102,细胞/组织基因组DNA提取试剂盒)

FastPure® Cell/Tissue Total RNA Isolation Kit(Vazyme #RC101,细胞/组织总RNA提取试剂盒)

HiScript® III RT SuperMix for qPCR (+gDNA wiper)〔Vazyme #R323,两步法RT-qPCR预混液(去基因组)〕

ChamQ SYBR qPCR Master Mix(Vazyme #Q311,高灵敏性染料法定量PCR检测试剂盒)

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研究背景

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昆虫种类繁多、形态各异,属于无脊椎动物中的节肢动物,是地球上数量最多的动物群体。水平基因转移(Horizontal gene transfer: HGT)是指跨不同物种直接进行基因水平传递,数量繁多的昆虫体内含有多少HGT基因、这类基因的来源及其生物学意义还有待研究。



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论文概述

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2022年7月18日,浙江大学农学院联合范德堡大学在Cell期刊在线发表题为“HGT is widespread in insects and contributes to male courtship in lepidopterans”的研究论文,该研究结合218个高质量的昆虫基因组以及HGT高通量筛选算法鉴定到1410个HGT基因。基于昆虫HGT基因和供体中的对应基因的比较基因组学研究,发现HGT基因伴随着昆虫适应性演化,它的基因功能和结构伴随着变化。进一步分析,发现蝴蝶和蛾均从李斯特菌Listeria中获得同一个水平转移基因LOC105383139,并验证了该基因对于两个物种繁育的重要作用。本研究系统性地解析了昆虫纲水平转移基因,为昆虫提供了高质量的HGT基因资源库,为昆虫生物科学、农业害虫防治、以及昆虫生物多样性研究提供了开创性思路。

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图1.水平基因转移在218昆虫中分布



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研究思路及成果

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图2.研究思路及成果



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Vazyme产品支撑

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高性能的科研产品助力高质量的科学研究,此项研究中,在提取昆虫DNA以及RNA过程中研究人员使用了诺唯赞柱式提取产品(Vazyme #DC102,Vazyme #RC101),对相关基因进行荧光定量检测其表达时使用了qPCR产品(Vazyme #R323,Vazyme #Q311),利用CRISPR-Cas9进行基因敲除过程中使用了体外转录产品(Vazyme #TR101)。

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图3.诺唯赞产品文中应用(图片来自原文)



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