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基本信息
论文题目：A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency
期刊：Cell
影响因子：41.584
作者及单位：北京大学生命科学学院/北大-清华生命科学联合中心的杜鹏研究员为该论文的通讯作者。北京大学前沿交叉学科研究院博士研究生齐烨和生命科学学院博士研究生丁力为本文的并列第一作者。
Vazyme合作产品：
Annexin V-PE/7-AAD Apoptosis Detection Kit（Vazyme #A213，细胞凋亡检测试剂盒），VAHTS® Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #NR602，链特异性转录组建库），Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit（Human/Mouse/Rat）〔Vazyme #N408，珠蛋白（Globin）mRNA及rRNA去除试剂盒〕。
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研究背景
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癌症泛指所有的恶性肿瘤，是一类细胞异常增殖的疾病，全球大约六分之一的死亡由癌症造成[1]。近年来，miRNA被认为是影响癌症发生的重要RNA分子，miRNA参与各种生理活动，许多miRNA可以直接靶向并抑制细胞周期基因，从而直接控制细胞增殖[2]。有研究表明，miRNA剂量减少是诱发癌症的主要原因之一[3]，但其减少的原因尚不清楚。因此，能否通过修复肿瘤中miRNA剂量减少引起的缺陷通路从而实现对于肿瘤细胞增殖的抑制，是目前研究的关键点。
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论文概述
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2022年5月26日，北京大学杜鹏团队在《Cell》杂志上在线发表了题为“A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency”的研究论文，研究发现不同的人类原发性癌症样本和癌症细胞系中广泛积累着不能有效结合AGO2复合体的3’末端短1-nt的miRNA异构体。植物免疫蛋白RDR1可以修饰这些AGO2游离出的miRNA双链异构体，进而重新激活有缺陷的miRNA通路，以此来特异性阻断实体瘤和白血病中癌细胞的细胞周期，其模式图如下。
图1.植物RDR1修复缺陷miRNA实现抗肿瘤作用模式图（图片来自原文）
该研究阐明了植物免疫蛋白RDR1抑制癌细胞细胞周期的机理，为开发新的癌症治疗方案提供了潜在的研究方向。
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研究思路及成果
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图2.研究思路及成果
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Vazyme产品支撑
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PDR1在哺乳动物细胞中异位表达后，检测其对癌症细胞系的抑制情况时，研究人员使用了诺唯赞细胞凋亡检测产品（A213），本产品染色特异性强，且PE染料为红色荧光，可与绿色荧光实现共染。
验证PDR1干扰哺乳动物癌症细胞的细胞周期时进行了转录组测序，在建库过程中使用了诺唯赞链特异性转录组建库试剂盒（NR602），本产品保留了mRNA的链方向性，更加准确的获得基因的结构以及基因表达信息，对于复杂植物模板具有很高的成功率；提供优化的大片段建库方案，测序数据与Illumina试剂具有高度的一致性。
在转录组测序建库前处理血液总RNA样本时，研究人员使用了珠蛋白（Globin）mRNA及rRNA去除试剂盒（N408）将Globin mRNA及rRNA从总RNA中去除，本产品对低质量RNA样本也具备高效去除效率，且起始模板量可低至10 ng。
图3.诺唯赞产品文中应用（图片来自原文）
A213 相关产品信息
产品名称及货号
Annexin V-PE/7-AAD Apoptosis Detection Kit（Vazyme #A213）
产品描述
Annexin V是一种35-36 kDa的Ca2+依赖性磷脂结合蛋白，与PS具有高度亲和力，故可通过细胞外侧暴露的PS与凋亡早期细胞的细胞膜结合。将Annexin V以藻红蛋白（Phycoerythrin，PE）进行标记，标记后的Annexin V保留了与PS的高亲和力，可作为探针，利用流式细胞仪进行细胞凋亡的检测。由于在凋亡早期即发生PS外翻，故Annexin V-PE染色在凋亡早期就能识别出凋亡的发生。7-氨基放线菌素（7-AAD）是一种核酸染料，7-AAD不能透过正常细胞或早期凋亡细胞完整的细胞膜，但可穿透膜损伤细胞如晚期凋亡细胞或者坏死细胞的细胞膜并与其内的DNA结合，可用来区分早期凋亡细胞和晚期凋亡细胞或坏死细胞。因此将Annexin V-PE与7-AAD进行共染，就可以区分不同凋亡时期的细胞。
订购信息
NR602 相关产品信息
（备注：该产品已下线，可使用N401+NR605满足RNA建库的实验需求）
产品名称及货号
VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #NR605）
产品描述
VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的转录组文库构建专用试剂盒。试剂盒包含两种类型的cDNA二链合成Buffer，可根据需要选择普通转录组或链特异转录组建库。试剂盒将二链合成、末端修复dA-Tailing合并为一步，缩短了建库时间。优化的反应体系，提高了文库转化效率，能兼容更低起始投入量，对不同起始量的RNA都有均一的覆盖度。本试剂盒利用磁珠分选的方式，可以快速获得特定长度的文库，能够满足不同实验的个性化需求。试剂盒包含的所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证，最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
订购信息
N408 相关产品信息
产品名称及货号
Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit（Human/Mouse/Rat）（Vazyme #N408）
产品描述
Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit（Human/Mouse/Rat）是针对血液样本总RNA中去除珠蛋白（Globin）mRNA及rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.01-1 μg的血液总RNA，总RNA样本经过Globin mRNA和rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤，最终将Globin mRNA及rRNA（包括细胞质rRNA和线粒体rRNA）从总RNA中去除，保留其它mRNA以及非编码RNA，可用于LncRNA等非编码RNA的分析；本试剂盒可兼容部分降解的RNA样本，所得到的产物适用于RNA文库构建及其它实验。
订购信息
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【参考文献】
[1] Ferlay J, Ervik M, Lam F, et al. (2020). Global Cancer Observatory: Cancer Today. Lyon: International Agency for Research on Cancer.
[2] Hydbring, P., Wang, Y., Fassl, A, et al. (2017). Cell-cycle-targeting microRNAs as therapeutic tools against refractory cancers. Cancer Cell 31, 576–590.e8.
[3] Ramı´rez-Moya. J, Wert-Lamas. L, Riesco-Eizaguirre. G, et al. (2019). Impaired microRNA processing by DICER1 downregulation endows thyroid cancer with increased aggressiveness. Oncogene 38, 5486–5499.
