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书名 : 生物信息学实验简明教程
ISBN : 9787511159892
作者 : 韩毛振、刘晓晖、郭伟
单价 : 68.00 元
版次 : 2025年1月第1版
印次 : 2025年1月第1次印刷

全书共包括十九个精心设计的实验,内容涵盖生物信息学资源和文献的检索、Linux系统的使用、生物数据库的利用和数据的获取,生物信息学环境的搭建和工具的安装、Python和R语言的编程基础及绘图,序列比对的在线和本地化分析、系统发育分析及可视化、单菌基因组学、核酸和蛋白质序列分析、基因和蛋白的功能注释、蛋白质结构预测与可视化、16SrRNA扩增子数据分析、短序列读长和长序列读长的宏基因组数据分析、转录组学、宏病毒组学、单细胞组学和生物网络构建等。更为重要的是本书编写的同时为了适应不同的读者,相应实验内容又分为Windows和Linux/Unix系统下的实现方式,并配合详细的步骤说明和大量的示例代码,可以让读者通过实践操作来加深理解这些内容,更快的实现不同类型数据的分析。

韩毛振,博士,安徽医科大学生命科学学院副教授,先后主持国家自然科学基金青年科学基金项目、安徽省优秀青年基金项目、安徽省省级科学研究项目和省级质量工程项目。研究方向为微生物组学数据的整合挖掘及菌群在健康和环境领域的相关机制和转化。在Gut、Chem Eng J、JHazard Mater、Gutmicrobes和GPB等期刊发表SCI论文43篇(其中作为第一或通讯作者发表的有27篇),出版专著2部,获得授权发明专利3项、软著9项。教授“生物信息学”和“生物信息学实验课”等课程。指导学生获批国家级创新创业项目2项、省级创新创业项目1项,获得国家级竞赛二等奖1项,省级B类比赛一等奖2项、二等奖2项、三等奖2项,获优秀指导教师,安徽医科大学优秀党员、优秀班主任等称号。

实验一 生物信息网站资源和文献检索技术
实验二 Linux系统入门与操作
实验三 生物信息数据库资源和数据获取
实验四 生物信息学环境搭建和工具安装
实验五 Python基础语法与简单使用
实验六 R语言基础语法与简单绘图
实验七 序列比对的在线分析和本地化分析
实验八 系统发育树的构建与可视化
实验九 单菌基因组序列拼接与基因预测
实验十 核酸序列和蛋白质序列分析
实验十一 基因和蛋白质的功能注释
实验十二 蛋白质结构预测与可视化
实验十三 16S rRNA扩增子数据分析
实验十四 短序列读长的宏基因组数据分析
实验十五 长序列读长的宏基因组数据分析
实验十六 转录组数据分析
实验十七 宏病毒组数据分析
实验十八 单细胞组学数据分析
实验十九 生物网络的构建
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