伟大科学家的对话，
向《物种起源》发起挑战，
科学方法论证生命起源之谜！
在《物种起源》一书中，达尔文公开承认进化论存在重大缺陷，并阐述了他疑惑的关键点。然而当今的唯达尔文主义教育论支持者不希望这些疑虑被传播到学生那里。本书着重强调达尔文重要的疑问——寒武纪大爆发之谜。
查尔斯·达尔文知道他提出的理论并没有解释生命历史的一个重大难题——“寒武纪生命大爆发”，许多生物突兀地出现在5.3亿年前的化石纪录中，而这之前的岩层化石中并未发现其先祖形式。这些生物不可能凭空而生，他们是如何进化而来？他们的祖先是谁？其中间的过渡体又是什么？
这一论题引起了全世界生物科学家们的广泛思考，并开展了激烈讨论。以理查德·道金斯、克里斯托弗·希钦斯为首的一批生物学家们，坚决拥护达尔文进化论，出版了一批较为读者认可的畅销图书，如《上帝错觉》，尖锐地抨击反对派“智能设计论”的生物起源观点。而本书的出版对此进行了有力驳斥，从寒武纪化石到全世界科学家的实验研究，透过鲜活的案例分析，进行了一场科学挑战。
《达尔文的疑问》引用了近现代世界范围内一百多位生物学家的对话，重点阐述了自然选择与随机突变在生物进化史中的不确定性，智能设计理论的合理性，向传统达尔文进化论提出挑战，探索生物进化之谜。

达尔文曾在著名作品《物种起源》中，公开承认他的进化理论存在重大缺陷，即无法解释寒武纪生命大爆发，因无法找到其前体化石或中间过渡态证据，也成了达尔文抱憾终身的疑问。在《达尔文的疑问》一书中，斯蒂芬?迈耶围绕“寒武纪生命大爆发”这一神秘问题展开讨论，清晰、真实、严谨、全面，富有逻辑性且信息量巨大。书稿围绕主题论点，提出各种“进化论”严重错误的证据，从正面肯定了智能设计理论。科学论证了生命起源于一种科学的智能设计运动，而非自然选择和进化突破。
《达尔文的疑问》清楚、准确地描述了“寒武纪生命大爆发与生命起源”的各个层面。他的书为进化研究的变革者寻求动物起源新理论方面指出了正确方向。迈耶延伸了他上一本书《细胞签名》里所描述的令人信服的理由，迈耶赞同智能设计理论，该理论坚信宇宙和生命体的某些特征可以被智能设计而不是诸如自然选择一类的无导向过程，并成为寒武纪生命起源的至佳诠释。
《达尔文的疑问》，全书由三部分组成：一部分，失踪的化石之谜，该部分讲述了达尔文的生物进化理论，阐明了达尔文的疑问，寒武纪大爆发生命起源问题，科学家们无法找到史前化石证据支撑达尔文进化学说；第二部分，如何创建动物，从基因、蛋白质大分子，表观遗传学角度分析生物进化论；第三部分，达尔文之后是什么？提出智能设计论，案例式科学分析其可行性。

009 引言
013 一部分 失踪的化石之谜
1 达尔文的复仇神
2 伯吉斯动物寓言集
3 柔软的躯体和强硬的真相
4 并未失踪的化石？
5 基因讲述的故事？
6 动物生命之树
7 间断平衡！
第二部分 如何构建动物
8 寒武纪信息大爆发
9 组合通胀
10 基因和蛋白质的起源
11 假设一个基因
12 复杂适应性及新达尔文主义数学
13 躯体模式的起源
14 表观遗传革命
第三部分 达尔文之后是什么？
15 后达尔文主义世界和自组织
16 后(新)达尔文主义时代
17 智能设计的可能性
18 寒武纪大爆发设计的征象
19 科学的规则
20 面临的风险
致谢
注释

斯蒂芬·C.迈耶，《达尔文的疑问》由美国人斯蒂芬•C•迈耶编写，英国剑桥大学科学哲学博士。现任华盛顿西雅图发现研究所科学与文化中心主任，探究生命起源，智能设计运动发起人之一。他撰写的《细胞签名》，被评为“泰晤士报文学增刊年度奖”。梅尔在TOP级的美国国家电视网，主要电台谈话节目和美国国家公共广播电台，基督教的主要媒体频频露面。他还曾2次登上《纽约时代周刊》的头版故事。