内容简介：

        近几十年来，我们见证了计算机和计算技术的应用逐渐扩展到人类生活的各个领域。在科学领域中，计算机存储、管理和整合大量数据和信息的能力，推动了以数据和信息为中心的新学科的产生，也促进了生物医学信息学、材料信息学、地理空间信息学等更多新型交叉学科领域的兴起。有一种计算机友好的科学信息组织策略日益占据主导地位，该策略与一个术语相关，即“本体 ”。本书深入浅出地介绍了介绍生物医学领域相关的应用本体，涵盖本体论的理论组成、本体构建的最佳实践，以及100多个广泛使用的基于基本形式化本体（BFO）的本体应用实例，不但可以供生物医学本体的新手作为入门的培训教材，也是专业研究者不可多得的参考书籍。

主译推荐：

       作为一个初学者，无论来自什么学科背景，在刚接触本体的时候都是懵的。当痛下决心努力啃完语义网（Semantic Web）的那几本黑色红色的经典英文教程、看完网络上年代久远的仅有几种入门手册后，仍然会有(不限于)以下困惑：

• （知识）本体来源于哲学本体论，具体的体现是什么？

• 本体和分类法/术语集的联系和区别是什么？UMLS和SNOMED CT是本体吗？

• 本体和知识库/知识图谱/数据库的关系呢？

• 为什么需要本体？本体有什么用？顶层本体是什么？有什么用？

• Concept, Class, Type, Category,Universal, Instance, Individual, Particular这些术语之间的联系和区别呢？

• Protégé中的entity/class/instance/property和RDF(S) & OWL中的class/individual/property、面向对象编程的Class/Instance、数据库设计的entity/relationship是不是一回事呢？

• 类（class）和实例（instance）的本质区别是什么？

• 要不要建实例（instance）？什么情况下建实例？分类结构下的最下面一层是类还是实例？为什么GO、HPO这些经典的本体里面都是类，看不到实例呢？

• 碰到多个父类的情况如何处理？

• 本体中类间关系遵循all-some原则，知识图谱/数据库的关系也一样吗？

        该书由著名的本体学家Barry Smith教授团队撰写，内容精炼，深入浅出，不仅清晰梳理了本体的哲学渊源、种类、与专业分类表/术语集的关系等理论基础，还基于OBO Foundry社区的本体构建经验，总结了几十条最佳实践原则。本书还详细论述了基本形式化本体（Basic Formal Ontology, BFO）及其实际应用案例，该顶层本体目前已获得上百个领域本体的复用，其ISO标准（ISO/IEC21838-2）已正式发布，我们也获得授权随书翻译并发布了BFO中文版。本书是生物医学信息领域目前仅有的系统介绍本体构建原理与实践和BFO的中文参考资料，同样也适应其他领域的本体研究与开发。