本书据明万历二十九年辛丑(1601)《古今医统正脉全书》本整理。全书3卷。上卷总论医理，广泛阐述有关养生、诊法、病机、本草理论等问题。中、下卷分述内科、妇产、小儿等科多种常见病的证候及治疗。本书系作者晚年总结其临床心得之作，其中不少见解和治疗经验对当今中医临床有很好的借鉴。本次整理新增方剂索引，便于读者查阅。

卷上
原道论*一
原脉论第二
摄生论第三
阳论第四
察色论第五
伤寒论第六
病机论第七
气宜论第八
本草论第九
卷中
中风论第十
疠风论第十一
破伤风论第十二
解利伤寒论第十三
热论第十四
内伤论第十五
疟论第十六
吐论第十七
霍乱论第十八
泻痢论第十九
心痛论第二十
卷下
咳嗽论第二十一
虚损论第二十二
消渴论第二十三
肿胀论第二十四
眼目论第二十五
疮疡论第二十六
瘰疬论第二十七
痔疾论第二十八
妇人胎产论第二十九
附带下论
大头论第三十
附雷头风
附耳论
小儿斑疹论第三十一
药回略第三十二附针法
附诸吐方法
中药方剂索引