本版保留了第1版图谱中病原菌在各种临床实验室常规使用培养基上的菌落形态和不同染色方法的镜下形态,并在原九篇基础上新增了抗病毒药物和敏感性试验方法、抗寄生虫药物和敏感性试验方法及常见病原体的病理学组织切片染色形态学诊断方法等3章内容。应临床一线广大微生物检验工作人员要求，在第一章中增加了显微摄影的内容，简要介绍在临床微生物检验工作中的摄影方法。第五章微生物商品手工和自动化检验系统中增加基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术在临床微生物检验中的应用和全实验室自动化内容。第九章临床常见标本的采集、运送及处理中增加眼、耳、鼻、喉部感染标本采集、运送及处理内容。第十一章细菌分类与命名中增加细菌新种的鉴定、命名和合格发表内容。由于质谱和测序技术的应用，使得以前不能鉴定到种的菌株获得明确鉴定。全书内容分为10篇共42章，内容涵盖病原微生物检验技术与方法、病原微生物流行病学分析方法、病原微生物（包括病毒、细菌、真菌和寄生虫）鉴定及药敏试验方法、医院感染与监测方法、临床微生物检验的质量管理与控制等。