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基于MPI的大数据高性能计算导论高性能计算、MPI、数据科学

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商品详情

  商品基本信息
商品名称:  基于MPI的大数据高性能计算导论
作者:  [法] 弗兰克·尼尔森(Frank Nielsen)
市场价:  59.00
ISBN号:  9787111602149
版次:  1-1
出版日期:   
页数:  217
字数:  184
出版社:  机械工业出版社
  目录
目录
译者序
前言
致谢
第一部分基于消息传递接口的高性能计算
第1章走进高性能计算
1.1什么是高性能计算
1.2为什么我们需要HPC
1.3大数据:四个特性(数据量、多样性、生成速度、价值)
1.4并行编程范式:MPI和MapReduce
1.5粒度:细粒度并行与粗粒度并行
1.6超级计算架构:内存和网络
1.7加速比
1.7.1扩展性和等效率分析
1.7.2Amdahl定律:描述数据规模固定时渐近加速比的变化趋势
1.7.3Gustafson定律:可扩展的加速比,随着资源的增加不断扩大数据量
1.7.4在串行计算机上模拟并行机
1.7.5大数据和并行输入/输出
1.8关于分布式系统的八个常见误区
1.9注释和参考
1.10总结
1.11练习
参考文献
第2章MPI简介:消息传递接口
2.1基于MPI的并行程序设计:基于消息通信
2.2并行编程模型、线程和进程
2.3进程之间的全局通信
2.3.1四个基本的MPI原语:广播、收集、归约和全交换
2.3.2阻塞与非阻塞和同步与异步通信
2.3.3阻塞通信产生的死锁
2.3.4并发性:局部计算可以与通信重叠执行
2.3.5单向与双向通信
2.3.6MPI中的全局计算:归约和并行前缀(扫描)
2.3.7采用通信器定义通信组
2.4同步屏障:进程的交汇点
2.4.1MPI中的一个同步示例:测量运行时间
2.4.2整体同步并行计算模型
2.5开始使用MPI:使用OpenMPI
2.5.1用MPI C++编写“Hello World”程序
2.5.2用C绑定进行MPI编程
2.5.3通过C++ Boost使用MPI
2.6通过OpenMP使用MPI
2.7MPI中的主要原语
2.7.1广播、散播、收集、归约和全归约的MPI语法
2.7.2其余混杂的MPI原语
2.8环形拓扑上利用MPI进行的通信
2.9MPI程序示例及其加速比分析
2.9.1MPI中的矩阵向量积
2.9.2MPI归约操作示例:计算数组的阶乘和最小值
2.9.3MonteCarlo随机积分算法估算π
2.9.4MonteCarlo随机积分算法估算分子体积
2.10注释和参考
2.11总结
2.12练习
参考文献
第3章互联网络的拓扑结构
3.1两个重要概念:静态与动态网络,以及逻辑与物理网络
3.2互联网络:图建模
3.3一些描述拓扑结构的属性
3.3.1度和直径
3.3.2连通性和对分
3.3.3一个好的网络拓扑结构的标准
3.4常见的拓扑结构:简单的静态网络
3.4.1完全图:团
3.4.2星形图
3.4.3环和带弦环
3.4.4网(网格)与环面簇(环面的集合)
3.4.5三维立方体与循环连接立方体
3.4.6树与胖树
3.5超立方体拓扑结构以及使用格雷码进行节点标识
3.5.1超立方体的递归构造
3.5.2使用格雷码对超立方体节点编号
3.5.3使用C++生成格雷码
3.5.4格雷码和二进制码的相互转换
3.5.5图的笛卡儿乘积
3.6一些拓扑结构上的通信算法
3.6.1有向环上的通信原语
3.6.2超立方体上的广播:树状通信
3.7将(逻辑)拓扑结构嵌入到其他(物理)拓扑结构中
3.8复杂规则拓扑结构
3.9芯片上的互联网络
3.10注释和参考
3.11总结
参考文献
第4章并行排序
4.1串行排序快速回顾
4.1.1主要的串行排序算法
4.1.2排序的复杂性:下界
4.2通过合并列表实现并行排序
4.3利用秩实现并行排序
4.4并行快速排序
4.5超快速排序
4.6正则采样并行排序
4.7基于网格的排序:ShearSort
4.8使用比较网络排序:奇偶排序
4.9使用比较网络合并有序列表
4.10双调归并排序
4.11注释和参考
4.12总结
4.13练习
参考文献
第5章并行线性代数
5.1分布式线性代数
5.1.1数据科学中的线性代数
5.1.2经典线性代数
5.1.3矩阵向量乘法:y=Ax
5.1.4并行数据模式
5.2有向环拓扑上的矩阵向量乘积
5.3网格上的矩阵乘法:外积算法
5.4二维环面拓扑上的矩阵乘积
5.4.1Cannon算法
5.4.2Fox算法:广播相乘循环移位矩阵乘积
5.4.3Snyder算法:在对角线上进行本地乘积累加
5.4.4Cannon、Fox和Snyder算法的比较
5.5注释和参考
5.6总结
5.7练习
参考文献
第6章MapReduce范式
6.1快速处理大数据的挑战
6.2MapReduce的基本原理
6.2.1map和reduce过程
6.2.2历史视角:函数式编程语言中的map和reduce
6.3数据类型和MapReduce机制
6.4MapReduce在C ++中的完整示例
6.5启动MapReduce作业和MapReduce架构概述
6.6基于MRMPI库在MPI中使用MapReduce
6.7注释和参考
6.8总结
参考文献
第二部分面向数据科学的高性能计算
第7章基于k均值的划分聚类
7.1探索性数据分析与聚类
7.1.1硬聚类:划分数据集
7.1.2成本函数和模型聚类
7.2k均值目标函数
7.2.1重写k均值成本函数以对聚类效果进行双重解释:聚类簇内数据或分离簇间数据
7.2.2k均值优化问题的复杂性和可计算性
7.3Lloyd批量k均值局部启发式方法
7.4基于全局启发式的k均值初始化方法
7.4.1基于随机种子的初始化方法
7.4.2全局k均值:最佳贪心初始化
7.4.3kmeans ++:一种简单的概率保证的初始化方法
7.5k均值向量量化中的应用
7.5.1向量量化
7.5.2Lloyd的局部最小值和稳定Voronoi划分
7.6k均值的物理解释:惯性分解
7.7k均值中k的选择:模型选择
7.7.1基于肘部法则的模型选择
7.7.2模型选择:用k解释方差减少
7.8集群上的并行k均值聚类
7.9评估聚类划分
7.9.1兰德指数
7.9.2归一化互信息
7.10注释和参考
7.11总结
7.12练习
参考文献
第8章层次聚类
8.1凝聚式与分裂式层次聚类及其树状图表示
8.2定义一个好的连接距离的几种策略
8.2.1一个用于凝聚式层次聚类的通用算法
8.2.2为元素选择合适的基本距离函数
8.3Ward合并准则和质心
8.4从树状图中获取平面划分
8.5超度量距离和进化树
8.6注释和参考
8.7总结
8.8练习
参考文献
第9章有监督学习: kNN规则分类的理论和实践
9.1有监督学习
9.2最近邻分类:NN规则
9.2.1最近邻查询中欧几里得距离计算的优化方法
9.2.2最近邻(NN)规则和Voronoi图
9.2.3利用kNN规则通过表决来增强NN规则
9.3分类器性能评估
9.3.1误判错误率
9.3.2混淆矩阵与真/假及阳性/阴性
9.4准确率、召回率和F值
9.5统计机器学习和贝叶斯最小误差界
9.5.1非参数概率密度估计
9.5.2误差概率和贝叶斯误差
9.5.3kNN规则的误差概率
9.6在计算机集群上实现最近邻查询
9.7注释和参考
9.8总结
9.9练习
参考文献
第10章基于核心集的高维快速近似优化和快速降维
10.1大规模数据集的近似优化
10.1.1高维度的必要性示例
10.1.2高维度上的一些

   内容简介
    本书使用MPI标准介绍了数据科学中的高性能计算,帮助读者了解分布式存储模型中的并行编程的知识。全书分为两部分,第一部分(第1~6章)基于消息传递接口介绍高性能计算,内容包括:阻塞与非阻塞的点对点通信、死锁、全局通信函数(广播、散播等)、协同计算(归约)的基本概念;互联网络的拓扑结构(环、环面和超立方体)以及相应的全局通信程序;基于分布式内存的并行排序及其实现,涵盖相关并行线性代数知识;MapReduce模型。第二部分(第7~11章)介绍计算机集群中的高性能数据分析,内容包括:数据聚类技术(平面划分聚类、层次聚类);基于k-NN的有监督分类;核心集以及相关降维技术;图算法(稠密子图、图同构检测)。每章章末附有各种难度的练习和参考文献,可供读者进行自测和深入学习。本书适合作为“高性能计算”相关课程的本科生教材。
    
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