本书集中于“玉米种子萌发蛋白质组学”这一专题，汇集了作者近10年的研究成果，同时引用了国内外许多文献资料，从蛋白质组学的角度对玉米种子萌发、盐胁迫对种子萌发的伤害和适应机制以及萌发过程中的蛋白磷酸化问题进行了较全面的阐述，可以说是目前玉米种子萌发蛋白质组学研究方面较为全面的一本书籍。

本书采取蛋白质组学方法，对玉米种子萌发过程中蛋白质组的变化进行分析，在此基础上，探讨了萌发过程中NaCl胁迫对玉米种子蛋白质组的影响，并利用离线强阳离子交换色谱技术富集蛋白，对萌发的玉米胚进行了广泛的蛋白质磷酸化调查，对探讨玉米种子萌发的机理、完善种子生物学研究有重要的意义。全书共分六章，内容包括蛋白质组学概念、产生背景、研究策略与范畴、常用的研究技术与方法、当前的研究现状与发展趋势、植物种子蛋白质组学研究现状、玉米种子萌发过程胚和胚乳蛋白质变化分析、NaCl胁迫下玉米种子萌发蛋白质变化分析以及玉米种子萌发胚中磷酸化蛋白质鉴定等方面的研究。
本书适合农学、生物学等相关学科的研究人员和师生参考。

孟令波，哈尔滨学院，副教授，农学博士。2008年获东北林业大学“林木遗传育种”专业博士学位，2010年至2013年在东北农业大学“园艺学”博士后流动站完成博士后研究。现为哈尔滨学院“环境生态工程”专业教师、哈尔滨学院青年骨干教师、黑龙江省微生物学会常务理事，黑龙江省生物工程学会理事。
自2003年开始，长期致力于从事“生物化学”“分子生物学”等课程的教学和“植物分子生物学”方面的研究工作，研究方向涉及“玉米种子萌发蛋白质组学研究”“细菌性角斑病诱导的黄瓜叶片cDNA文库构建及相关基因研究”“黄瓜耐高温种质资源筛选及耐高温特性研究”等。主持黑龙江省自然科学基金、黑龙江省高校青年学术骨干支持项目、黑龙江省省博士后科研启动基金等科研项目6项，发表SCI收录学术论文5篇，中文核心期刊论文7篇；授权发明专利2项、实用新型专利1项。
（一）代表性论文：
1. Lingbo Meng, Xiaotong Yao, Zichao Yang, Runzhi Zhang, Chunyi Zhang, Xuerong Wang, Ning Xu,Shumin Li*, Tongtong Liu, Chengyu Zheng. Changes in soil microbial diversity and control of Fusarium oxysporum in continuous cropping cucumber greenhouses following biofumigation. Emirates Journal of Food and Agriculture, 2018. 30(8): 644-653；（SCI收录）
2. Lingbo Meng, Aiyuan Zhang, Fei Wang, Xiaoguang Han, Dejiang Wang, and Shumin Li*. Arbuscular mycorrhizal fungi and rhizobium facilitate nitrogen uptake and transfer in soybean/maize intercropping system,Frontiers in plant science, 2015,6(05):1~10；（SCI收录）
3. Lingbo Meng , Chen YB , Lu TC,Wang YF, Qian CR,Yu Y, Ge XL, Li XH*, Wang BC*. A systematic proteomic analysis of NaCl-stressed germinating maize seeds,Molecular Biology Reports, 2014,41(04):3431~3443；（SCI收录）
4. Tian Cong Lu#, Ling Bo Meng#,Chuan Ping Yang, Gui Feng Liu, GuanJun Liu,Wei Ma,BaiChen Wang*, A shotgun phosphoproteomics analysis of embryos in germinated maize seeds,Planta, 2008,228(06):1029~1041；（SCI收录）
5. ZhenHai Sun, Lingbo Meng*,Hua Lin. Diaquabis [5-(2-pyridyl)-1H-tetrazo- latoκ2N1、N5 ] cobalt(II). Acta Crystallographica Section E, 2009, 65(04):280
6. 孟令波，刘彤彤，张春怡，李淑敏*，高宇，黄沛荣. 棚室茄子不同栽培方式对土壤微生物多样性的影响. 东北农业大学学报，2017,48(11):18-25；
7. 孟令波，刘关君，李淑敏，徐丹丹，秦智伟*.黄瓜非特异性脂质转移蛋白基因的序列分析及细菌性角斑病菌浸染下的表达，东北农业大学学报，2013，44（01）:55-60；
（二）主持的代表性科研项目
1. 黑龙江省自然科学基金联合引导项目（LH2019C041），设施栽培下嫁接茄子根系分泌物与土壤微生物互作机制的研究，主持；
2. 黑龙江省博士后落户基金（LBH-Q16140），设施茄子连作障碍生物修复技术的研究，主持；
3. 黑龙江省自然科学基金（C200937），玉米种子萌发的蛋白质组学研究，主持；
4. 黑龙江省博士后基金（LBH-Z06165），外源Ca2+对NaCl胁迫下玉米种子萌发蛋白质组的影响，主持；
5. 黑龙江省高校青年学术骨干支持项目（1151G081），黄瓜热胁迫诱导差异表达基因的分离、鉴定及序列分析，主持；
6. 黑龙江省高校重点实验室开放课题（ZK201209），玉米种胚与胚乳在萌发过程中蛋白质变化的研究，主持；
（三）授权的专利
1.发明专利：黄瓜谷胱甘肽硫转移酶基因CsGSTZ及其编码的氨基酸序列（ZL200910073095.9）（已授权）
2.发明专利：一种防治茄子黄萎病的茄子栽培方法（201610921617.6）（已授权）
3.实用新型专利：具有放大刻度及辅助加液功能的滴定管（201120218272.0）（已授权）
4．实用新型专利：一种原位连续收集植物根系分泌物的装置（2010206500097.8）（已授权）
5. 实用新型专利：一种直管地温表用保护套（201020650103.X）（已授权）
6. 实用新型专利：带可移动内底的培养皿（201320748507.6）（已授权）
（四）代表性获奖
1．东北血统优质紫长茄龙杂茄6号的选育及推广，黑龙江省科技厅，黑龙江省科学技术进步奖，三等奖，2015
2．东北血统优质紫长茄龙杂茄6号的选育及推广，黑龙江省农业委员会，黑龙江省农业科学技术奖，一等奖，2015
3．A shotgun phosphoproteomics analysis of embryos in germinated maize seeds，哈尔滨市科协，哈尔滨市自然科学技术学术成果奖，一等奖，2010
4. Diaquabis[5-(2-pyridyl)-1H-tetrazolato-κ2N1，N5 ]cobalt(II)，哈尔滨市科协，哈尔滨市自然科学技术学术成果奖，二等奖，2010

第1章 绪论 001
1.1 蛋白质组学产生的背景及相关概念 001
1.1.1 蛋白质组学的基本概念 001
1.1.2 蛋白质组学的历史和背景 002
1.1.3 蛋白质组学的特点与难点 003
1.2 蛋白质组学的研究策略与范畴 005
1.2.1 表达蛋白质组学 006
1.2.2 功能蛋白质组学 007
1.2.3 结构蛋白质组学 008
1.2.4 相互作用蛋白质组学 008
1.2.5 蛋白质组与基因组、转录组的相互关系 010
1.2.6 蛋白质组与糖组、代谢组的相互关系 011
1.3 蛋白质组学研究现状及发展趋势 013
1.3.1 农业蛋白质组学研究现状及发展趋势 013
1.3.2 医药蛋白质组学研究现状及发展趋势 019

第2章 蛋白质组学研究方法 022
2.1 蛋白质组学的研究技术 022
2.1.1 蛋白质组提取与样品制备 023
2.1.2 二维凝胶电泳与分析技术 028
2.1.3 图像分析与细胞蛋白质谱的建立 033
2.1.4 生物质谱技术与蛋白质鉴定 036
2.1.5 定量蛋白质组学研究技术 039
2.2 生物信息学在蛋白质组学上的应用 044
2.2.1 蛋白质生物信息学产生、发展及研究内容 044
2.2.2 蛋白质组研究中常用的网站及数据库 046
2.2.3 蛋白质组信息学技术的应用 054

第3章 植物种子蛋白质组学研究 056
3.1 种子蛋白质分类 057
3.2 种子发育过程蛋白质组学研究 057
3.2.1 组织分化阶段的关键蛋白质 058
3.2.2 与胚和胚乳发育相关的蛋白质 058
3.2.3 成熟干燥阶段的关键蛋白质 060
3.3 种子休眠相关蛋白质组学研究 060
3.4 种子萌发蛋白质组学分析及其调控研究 062
3.4.1 吸胀作用相关蛋白质 062
3.4.2 种子DNA和蛋白质的修复及贮存mRNA的作用 064
3.4.3 种子萌发过程中的蛋白质组分析 066
3.4.4 翻译后修饰对种子萌发的控制 068
3.4.5 植物激素对种子萌发的调节 070
3.5 植物种子的活力与保存 076
3.6 植物种子萌发蛋白质组学研究展望 077

第4章 玉米种子萌发过程蛋白质组学研究 079
4.1 蛋白质组学在玉米研究中的应用 079
4.1.1 玉米组织、器官蛋白质组学研究 079
4.1.2 玉米细胞器蛋白质组学研究 084
4.1.3 蛋白质标记玉米遗传作图 085
4.1.4 玉米抗病相关蛋白质组学研究 086
4.1.5 玉米抗逆境胁迫相关蛋白质组学研究 088
4.1.6 玉米蛋白质组学研究展望 089
4.2 玉米种子萌发胚和胚乳蛋白质组学分析 090
4.2.1 玉米种子萌发蛋白质组学分析方法 091
4.2.2 种子萌发胚、胚乳蛋白质变化2-DE分析 095
4.2.3 谱图变化点的蛋白质鉴定 099
4.2.4 玉米种子不同组织中蛋白质变化分析 100
4.2.5 种子萌发过程中贮藏物质的动员 101
4.2.6 参与逆境保护和调节相关蛋白 105
4.2.7 参与蛋白质合成、折叠和稳定的相关蛋白 108
4.2.8 光合固碳作用相关蛋白 109
4.2.9 氨基酸、核酸代谢及其他相关蛋白 111
4.2.10 种子萌发过程中不同组织的蛋白质组比较 112
4.2.11 种子萌发不同阶段的蛋白质组比较 113
4.2.12 种子萌发过程中保护相关蛋白质变化分析 113
4.2.13 种子萌发后幼苗生长筹备蛋白质分析 114

第5章 NaCl胁迫下玉米种子萌发蛋白质组学研究 115
5.1 盐胁迫对植物的影响 115
5.2 植物耐盐性基因 117
5.2.1 与渗透调节物质生物合成有关的基因 117
5.2.2 与自由基和有毒物质清除有关的基因 118
5.2.3 与细胞内离子的转运、平衡及区域化有关的基因 118
5.2.4 与细胞内水分转运和平衡有关的基因 118
5.2.5 与耐盐性相关的分子伴侣有关的基因 118
5.2.6 与盐逆境信号转导相关的调控因子或序列 119
5.3 植物耐盐性蛋白质 119
5.3.1 植物盐胁迫伤害机制的蛋白质组学分析 120
5.3.2 植物耐盐相关蛋白 123
5.4 NaCl胁迫对玉米种子萌发的影响 130
5.4.1 NaCl胁迫对玉米种子萌发能力的影响 131
5.4.2 NaCl胁迫对玉米种子萌发生长指标的影响 133
5.5 NaCl胁迫下玉米种子萌发蛋白质组分析 134
5.5.1 分析方法 134
5.5.2 蛋白质变化的2-DE分析 135
5.5.3 NaCl胁迫对所鉴定蛋白质表达水平的影响 143
5.5.4 NaCl胁迫对种子萌发贮藏产物动员的影响 146
5.5.5 盐胁迫下植物防御相关蛋白及其路径分析 148
5.5.6 盐胁迫下参与蛋白质合成、折叠和稳定的蛋白质分析 151
5.5.7 盐胁迫下光合固碳作用相关的蛋白质分析 152

第6章 玉米种子萌发磷酸化蛋白质组学研究 162
6.1 蛋白质磷酸化 162
6.2 磷酸化蛋白质组学 163
6.3 磷酸化蛋白质组学研究技术 163
6.3.1 磷酸化蛋白质的研究策略 163
6.3.2 磷酸化蛋白质检测 164
6.3.3 蛋白质磷酸化位点的分析 165
6.3.4 蛋白质磷酸化的定量分析 168
6.4 植物磷酸化蛋白质组学研究 169
6.4.1 模式植物磷酸化蛋白质鉴定 169
6.4.2 非模式植物磷酸化蛋白质鉴定 171
6.5 玉米种子萌发胚中磷酸化蛋白质鉴定 172
6.5.1 试验材料及试剂 172
6.5.2 试验方法 173
6.5.3 鸟枪法MS鉴定 174
6.5.4 种子萌发期基因表达水平分析 175
6.5.5 磷酸化蛋白质鉴定 179
6.5.6 鉴定蛋白质功能分析 179
6.5.7 参与DNA修复与整合的相关蛋白 182
6.5.8 转录相关蛋白 183
6.5.9 RNA剪接相关蛋白 183
6.5.10 蛋白质翻译相关蛋白 183
6.5.11 蛋白质分子伴侣 184
6.5.12 在种子萌发中钙调级联作用 184
6.5.13 细胞分裂相关激酶 186
6.5.14 代谢途径相关蛋白 186

参考文献 188

无