《五运六气入门讲记》共有6章。第1章讲天干地支，论述干支的起源、干支的涵义、干支与阴阳五行等问题；第2章讲五运，主要论述十干统运、五气经天化五运、大运以及推算方法、五音建运等知识点；第3章讲六气，讲述十二支化气、主气及推算方法、客主加临、南北政等问题；第4章讲运气相临，阐述运气相合出现的顺逆、同化等问题；第5章讲医易简说，介绍了太极、八卦、河图、洛书等与运气学说相关的知识点；第6章讲音律，简明扼要地介绍了律吕以及音律与阴阳五行天干地支的配合。书中附有55幅图表。

《子午流注针法》卷上为流注指微赋、流注经络井荥说、平人气象论经隧周环图及十二经脉的循行，主病图形；卷中论子午流注；卷下为井荥歌诀及图。书中探经络之原，求针刺之理，阐述营卫之清浊、区分孔穴之部位。强调人体经脉气血的流注、开合随干支配合的不同日时而变化。是既知很早的一种论述子午流注学说的专书。