近年来，随着测序、芯片、终点法基因分型等技术的迅速发展，在农业、畜牧业、人类健康等领域产生了海量的SNP数据。然而目前大部分实验室对于SNP数据的存储、管理，还处于很基础的阶段，缺少SNP数据分析和呈现的高效手段。

为了解决用户在海量SNP数据管理和应用上遇到的难题，百奥云数据科技有限公司开发了百奥云基因型大数据系统。百奥云基因型大数据系统，采用分布式处理、分布式数据库结构和云存储，便于扩展，易于管理大量基因型数据。

系统用户界面友好，一键式便捷操作，内置多种分析工具，可同时进行多项分析，可对不同批次的基因型数据进行有效的整合。

接下来我们从以下几个方面，为大家介绍百奥云基因型大数据系统的功能：

1.基因型数据导入- SNP位点、基因型数据；

2.基因型数据展示 - 染色体图展示、表格展示；

3.品种基因型比较 - 全库比较，1vs1或1vs多比较 ；

4.基因型数据分析-遗传距离、PCA、聚类分析、Structure，ADMIXTURE分析等。

基因型数据管理的基础是数据的导入，我们针对SNP标记信息和基因型数据，设计了“标记数据管理”和“基因型管理与分析”两大模块。

这两大模块都可以通过导入相关的数据文件完成数据的导入和整合。

系统支持多种文件格式，txt、zip、csv、tsv、gz、vcf、xls、xlsx，避免了客户转换格式的烦恼。

在使用SNP标记的过程中，不同的研究可能需要不同的SNP标记组合，我们将常用的固定组合定位为Panel，通过Panel完成的查询和分析，将大大提高系统的查找和分析速度。

百奥云基因型大数据系统允许多个用户同时导入多个数据文件，数据在后台自动解析、上传。对于巨量数据的上传，在下班后，系统可实现无人值守，持续工作，提高了系统资源的利用效率。

数据库中的标记信息，可以按照表格展示，也可以按照染色体位置展示。

全部标记	某个Panel的标记

基因型数据，可以展示已上传的所有信息，也可以通过不同的标记组合（Panel），检索用户感兴趣的样品的信息。

为了满足不同用户的习惯，我们还支持基因型结果表格的行列互换，既可以样品为列，又可以SNP为列。

样品为列

SNP为列

为便于用户寻找数据库中与目标材料基因型最接近的材料，我们设计全库比较的功能。系统可以从全库数据中，为客户挑选出最接近目标材料的5个、8个，或者10个材料，供用户参考。

用户如果需要比较1份材料或者多份材料与目标材料基因型的差异（简称1vs1，1vs多），可以使用我们的“样品基因型比较”功能。

1vs1

1vs多

除了表格展示的方式之外，我们还提供根据不同染色体数据统计的展示方式，以满足客户不同的需求：

遗遗传距离计算，群体结构分析，PCA分析，是最常见的分析内容，它们的应用十分广泛，能够帮助我们解决某些生物学问题。我们同时支持从系统中调用数据计算，或者由客户上传数据文件计算两种方式。

我们拥有专业的遗传距离计算与可视化展示工具。

遗传距离热图

PCA三维展示

进化树在生物学中，用来表示物种或材料之间的进化关系。用树状图或扇形图展示育种材料亲缘关系的远近，是育种科研工作者常用的手段。

在GWAS分析之前，需要对群体结构进行研究，群体结构是影响GWAS分析重要的参数之一。百奥云基因型大数据系统自带了群体结构分析功能，方便用户进行群体结构的分析。

K=8

百奥云以用户体验为出发点，以快捷高效为导向，在软件工程师、数据库专家、生物信息专家、育种家的通力合作之下，结合分子育种、实验室检测与分析的需求，打造了百奥云分子育种基因大数据系统。

我们的平台具有优良的数据库结构、完善的数据统计及分析功能、流畅的访问性能、多样的图形显示功能，为用户带来了全新的体验，树立了基因型大数据管理与应用的新标杆。

企业版本

    可定制开发

价格面议