全书分为绪论、生物信息数据库、数据库查询、序列比对与数据库相似性搜索、DNA序列分析、蛋白序列分析、生物信息学软件及使用、R与Bioconductor、GEO2R、富集分析、文献信息检索、EndNote20参考文献管理软件12部分。编者根据自己的教学实践，以图文并茂的方式介绍相关内容，以期使学生了解和掌握一些较常用的生物信息资源和工具。    本书是一本简明且实用性较强的生物信息学教程，适合生物学相关的非生物信息专业的学生使用，也可为从事生物学相关的教学、科研人员参考使用。

第2版前言

第1版前言

第1章  绪论

  1.1  生物信息学的概念及研究对象

  1.2  生物信息学的研究内容

  1.3  生物信息学的应用

第2章  生物信息数据库

  2.1  生物信息数据库的发展简史

  2.2  核酸序列数据库

  2.3  蛋白质序列数据库

  2.4  生物大分子结构数据库

  2.5  基因功能注释数据库

  2.6  其他生物分子数据库

第3章  数据库查询

  3.1  NCBI查询系统Entrez

  3.2  基因组数据库Ensembl

  3.3  蛋白质序列数据厍UniProt

第4章  序列比对与数据库相似性搜索

  4.1  概述

  4.2  序列比对的打分系统

  4.3  序列比对的算法

  4.4  双序列比对及基本操作

  4.5  多序列比对及基本操作

  4.6  数据库相似性搜索——BLAST

第5章  DNA序列分析

  5.1  核酸序列组成成分分析

  5.2  限制性内切酶酶切位点分析

  5.3  重复序列分析

  5.4  基因结构分析

  5.5  序列同源性分析

第6章  蛋白质序列分析

  6.1  蛋白质的一级结构分析

  6.2  蛋白质二级结构分析

  6.3  蛋白质三级结构分析

  6.4  蛋白质功能预测

第7章  生物信息学软件及使用

  7.1  引物设计软件

  7.2  综合序列分析软件

第8章  R与Bioconductor

  8.1  Bioconductor简介

  8.2  Bioconductor包的安装

  8.3  Bioconductor包应用举例

第9章  GEO2R

第10章  富集分析

  10.1  DAVID简介

  10.2  DAVID富集分析

第11章  文献信息检索

  11.1  学术搜索引擎

  11.2  文摘数据库检索

  11.3  全文数据库检索

  11.4  Web of Science引文数据库

第12章  EndNote20参考文献管理软件

  12.1  EndNote20的主要功能

  12.2  EndNote20数据库的建立

  12.3  EndNote数据库的管理

  12.4  EndNote数据库的应用

参考文献

附录  Windows环境下R与RStudio的安装