全书共分十六章。第一章至第四章旨在阐述新发突发传染病的流行病学基本理论和知识，包括新发突发传染病的发现和确定、新发传染病的风险评估和预警、新发传染病疫情的应对与处置及其相关的关键技术。第五章至第十一章则针对近年来全球关注的重大传染病疫情或能够导致全球大流行的传染病进行了流行病学特征以及预防控制的介绍，这些疾病包括传染性非典型肺炎（SARS）、人感染禽流感、甲型H1N1流感大流行、中东呼吸综合征（MERS）、埃博拉病毒病、寨卡病毒病、新型冠状病毒感染（COVID-19）等。第十二章至十四章，分别介绍了经血或体液传播的新发传染病，包括艾滋病、丙型病毒性肝炎和猴痘。第十三章和第十四章分别介绍了导致儿童感染并传播的手足口病和以及病媒传播的莱姆病。每个章节都提供了详尽的案例研究和应对分析。